Η ομάδα ποδοσφαίρου του 2ου ΕΠΑ.Λ. Τρικάλων αναδείχθηκε Πρωταθλήτρια Νομού Τρικάλων στο σχολικό πρωτάθλημα ποδοσφαίρου αγοριών για το σχολικό έτος 2016-2017. Ήταν η δεύτερη συνεχή χρονιά που κατέκτησε το πρωτάθλημα και έφτασε ξανά να αγωνιστεί στον τελικό του Πανθεσσαλικού πρωταθλήματος.
Αρχικά αγωνίστηκε στο τοπικό σχολικό πρωτάθλημα του Νομού Τρικάλων όπου στο δρόμο για τον τελικό αντιμετώπισε και νίκησε το 8o Γενικό Λύκειο Τρικάλων και το 1ο ΕΠΑΛ Τρικάλων. Στον τελικό που έγινε την Τετάρτη 1 Μαρτίου 2017 στο γήπεδο του Πυργετού, το 2ο ΕΠΑΛ νίκησε το 4o Γενικό Λύκειο Τρικάλων στη διαδικασία των πέναλτυ και κατέκτησε το πρωτάθλημα. Αναλυτικά τα αποτελέσματα ήταν τα εξής:
Την Τρίτη 14 Μαρτίου 2017, η ποδοσφαιρική ομάδα του 2ου ΕΠΑ.Λ. Τρικάλων αγωνίστηκε στο γήπεδο της Κρανιάς Καρδίτσας με αντίπαλο το 1ο ΕΠΑ.Λ Καρδίτσας για τα ημιτελικά του Πανθεσσαλικού Σχολικού Πρωταθλήματος Ποδοσφαίρου. Το 2ο ΕΠΑΛ Τρικάλων νίκησε με 3-1 και προκρίθηκε στον τελικό του Πανθεσσαλικού Σχολικού Πρωταθλήματος για 2η συνεχή χρονιά. Ο τελικός έγινε την Πέμπτη 16 Μαρτίου 2017 στο γήπεδο της Αγίας Μονής Τρικάλων. Το 2ο ΕΠΑΛ Τρικάλων αγωνίστηκε με αντίπαλο το 1ο Γενικό Λύκειο Λάρισας με σκοπό να υπερασπιστεί τον περσινό τίτλο. Προηγήθηκε με 1-0 αλλά ισοφαρίστηκε στις "τραβηγμένες" καθυστερήσεις που κράτησε ο διαιτητής και ηττήθηκε στα πέναλτυ με 2-4.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα ήταν τα εξής: